Predsjednik Republike Srpske:
-bira se izravno
-ima potpredsjednike bez ikakvih ovlasti
-predlaže suce za Ustavni sud RS
-samostalno predlaže premijera (mandatara)
-imenuje Senat RS
-može raspustiti Narodnu skupštinu i raspisati nove izbore
-može sazvati sjednicu Narodne skupštine
-ima pravo predlaganja zakona u parlamentu
-nema veto na zakone
-daje pomilovanja
-ne može ga smijeniti parlament
-potpisuje međunarodne sporazume u ime RS
Predsjednik Federacije:
-predlaže ga Dom naroda, uz nužnu podršku trećine svakog od tri kluba konstitutivnih naroda
-ima potpredsjednike s značajnim, mada ipak ne identičnim ovlastima
-predlaže ne samo premijera, nego i sve ministre, u suglasnosti s potpredsjednicima (premijer ne bira svoje ministre, oni mu se dodjeljuju i prema tome im on nije šef nego je samo prvi ministar među jednakima, zato je po Ustavu Federacije formalno "Predsjednik Federacije šef izvrsne vlasti")
-nema pravo predlaganja zakona
-ima veto na sve zakone, koji bez njegovog potpisa ne stupaju na snagu. Ukoliko ne potpiše, prema Poslovniku Predsjednik dostavlja Parlamentu objašnjenje razloga nepotpisivanja. Tim potezom zakon pada.
-predlaže suce ustavnog suda Federacije, uz suglasnost i konsenzus s dva potpredsjednika
-može raspustiti Federalni parlament, ukoliko se na vrijeme na usvoji proračun. No ako ima podršku oba potpredsjednika, u bilo kojem trenutku može raspustiti parlament.
-smijeniti ga može samo ustavni sud Federacije, ukoliko utvrdi da "nije dostojan obavljanja dužnosti", na zahtjev dvotrećinske većine oba doma federalnog parlamenta (39 delegata u Domu naroda, i 66 delegata u Zastupničkom domu). Novi Predsjednik se opet bira uz identičnu proceduru kao prethodnik.
-daje pomilovanja
-potpisuje međunarodne sporazume u ime Federacije. Može otkazati međunarodne sporazume koje ima Federacija ukoliko za to ima podršku BiH (ne FBiH) parlamenta.
Vjerojatno najvažnija razlika je u tome da Predsjednik RS može iz bilo kojeg razloga odlučiti raspustiti parlament i raspisati izbore, te može predlagati zakone, dok Premijer Federacije ima veto na zakone.
Dnevnik.ba